สถานะการณ์ภายหลังจากภาคแรก 3 ปียกยะจัดตั้งขึ้นกรุ๊ปขบถและขึ้นเป็นหัวหน้าก่อการศึกกับพวกคนแก่ กฏ BR ถูกนำกลับมาใช้อีกทีแบบชั่วร้ายกว่าเดิม ชิโอริลูกสาวของคุณครูคิตาโนะที่ถูกยกยะยิงตายไปเมื่อภาคที่แล้วต้องการค้นหาคำตอบเลยไปสมัครสำหรับเข้าเรียนในสถานที่เรียนซึ่งมีแต่พวกเด็กเหลือขอ แล้วเด็กกรุ๊ปนั้นก็ถูกคัดเลือกมาเล่นเกมแบบเดียวกับพวกยกยะคือถูกพาตัวมาที่ค่ายจับสวมปลอกคอมีคุณครูริกิที่ลูกสาวตายเพราะเหตุว่าพวกยกยะก่อกบฏเป็นคนควบคุม เกมนี้ไม่เหมือนกับภาคแรกคือให้จับแบบเป็นๆคู่ถ้าคู่ตายก็ต้องถูกระเบิดตายตามไปด้วยและไม่ได้ให้ล่าคุ้นเคยแม้กระนั้นให้ตามล่ายกยะกับพวกกบฏบนเกาะที่พวกยกยะหลบซ่อนอยู่ เกมนรก สถาบันพันธุ์โหด 2
เริ่มภารกิจแรกยังไปไม่ทันถึงเกาะก็เริ่มถูกกรุ๊ปของยกยะโจมตีตาย แล้วหลังจากนั้นก็ตายอีกขณะที่ไปเก็บลูกกระสุนปืนที่ถูกส่งลงมาจากเครื่องบิน พวกเด็กนักเรียนตัวหลักๆคือทากุกับพวกที่เหลือถูกพวกยกยะล้อมไว้ พวกยกยะใช้ระเบิดทำลายระบบและช่วยถอดปลอกที่เอาไว้สำหรับใส่คอ ริกิส่งทหารเข้าไปแม้กระนั้นพวกยกยะจัดแจงได้ ยกยะบอกจนถึงกรุ๊ปเด็กนักเรียนยอมเป็นพวกด้วย อยู่ๆสหรัฐอเมริกาก็ยิงอาวุธลูกแรก นายกสั่งให้ริกิจัดแจงเก็บกวาดให้หมดอีกทั้งเกาะริกิเองก็ใส่ปลอกคออยู่เช่นกัน ยกยะให้พวกเด็กนักเรียนหนีออกทางอุโมงค์ชิโอริไม่ยินยอมไปขออยู่ดูจนถึงวินาทีสุดท้าย ทากุกับเพื่อนพ้องอีกสองคนเปลี่ยนความคิดกลับมาสมทบกับยกยะ ริกิมาถึงบอกเรื่องที่ลูกถูกฆาตกรรมในเหตุการก่อกบฏระเบิดที่ปลอกที่เอาไว้สำหรับใส่คอริกิระเบิด ชิโอริถูกยิงเจ็บถามยกยะก่อนตายถึงโนริโกะยกยะกล่าวว่าโนริโกะเป็นคนที่กล้ามองตาและยิ้มให้บุคคลอื่นอย่างจริงใจ ยกยะกับทากุบุกออกไปก่อนที่จะอีกทั้งเกาะจะถูกถล่มพวกทากุกับที่เหลือถูกประกาศว่าหายสูญ ทากุกับยกยะตามมาสมทบกับพวกที่เหลือรวมถึงโนริโกะแล้วทั้งหมดทั้งปวงก็รวมตัวกันเดินหน้าถัดไป
